Лаборатория данных data@datalaboratory.ru
Карта резистентности кишечных микробиот

Биоинженеры из НИИ ФХМ анализируют метагеномы кишечных бактерий, а мы продолжаем визуализировать эти данные. Ещё один взгляд на способности кишечных бактерий, зашифрованные в их геномах — всемирная карта резистома (потенциальной устойчивости) бактерий к различным антибиотикам, биоцидам и металлам.

Резистом показан одновременно на географической (одно вещество, все страны) и тепловой (все вещества, все страны) карте. Уровень резистома измеряется на логарифмической шкале и закодирован трехцветным градиентом. Конкретное значение отображается при наведении на страну или ячейку хитмепа в интерактивной легенде справа. На тепловой карте дополнительно отображается разделение на когорты по возрасту, полу, заболеваниям участников исследования. На географической карте всегда показано медианное значение по стране.

Арт-директор: Таня Бибикова
Дизайнер: Кирилл Беляев
Технолог: Дамир Мельников

Спасибо Александру Тяхту, Константину Ярыгину и Борису Коварскому за новую задачу и полезные идеи в процессе работы. Проект профинансирован из гранта Российского научного фонда.

Сделано в августе 2016 года.

Публикация в журнале
Oxford Bioinformatics

resistomap.datalaboratory.ru
resistomap.datalaboratory.ru